星期三日本政府对环保团体成员强行登上日本捕鲸船的行为提出强烈抗议，同时表明将尽快交还扣押人员。日本捕鲸团体强调，日本捕鲸调查是为有效利用水产资源寻求科学根据，最终目的是希望重开商业捕鲸。
星期三，日本内阁官房长官町村信孝对于国际环保团体成员强行登上日本捕鲸船的行为提出强烈抗议。
据日本共同通讯社报导，町村在记者会上指责说，“环保成员的行为危险，日本政府对此表示强烈抗议”。共同社报导，日本水产厅接到报告，当地时间星期二，正在南极海域进行调查捕鲸的日本船只“勇新丸2号”遭到环保团体海上牧羊人两名成员的干扰，他们向船只投掷药瓶，并且强行登上船只，为此日本船员将两人扣押。
*日捕鲸普遍遭到反对*
日本的捕鲸调查一直成为国际环保团体谴责的对象。国际环保团体认为鲸鱼应该受到保护，反对利用各种名目的捕鲸行为。
负责捕鲸调查的日本鲸类研究所自去年11月派出包括研究人员在内的250多人和6艘捕鲸船在南极海域开始捕鲸调查活动。鲸类研究所公关科科长加布里埃尔.戈麦斯接受记者采访时强调，日本的捕鲸调查是为了得到水产资源的科学数据。
他说：“水产资源伴随需求的急剧增加有些鱼类开始减少，为了有效利用包括鲸鱼在内的水产资源，需要掌握科学数据”。
戈麦斯表明，日本打算通过捕鲸调查为重新开始商业捕鲸提供科学数据。
二战结束后的物资短缺时代，鲸鱼开始出现在日本人的餐桌上，并且保持至今。国际环保团体批评日本借研究之名实际是为市场提供鲸鱼。
鲸类研究所公关科科长加布里埃尔.戈麦斯承认，调查船捕获的鲸鱼最终进入流通市场，不过这是研究的副产品。他说：“研究鲸鱼的活动需要大量资金，这主要是靠国家拨款以及作为研究的副产品进入市场的鲸鱼销售额”。
该研究所表示，此次捕鲸调查预定今年4月结束。
另据报导，被日本捕鲸船扣留的两名环保团体成员将移交给环保团体。日本的读卖新闻报导称，日本水产厅表示已经开始办理移交手续。日本政府表示，此事不会影响日本与相关国家的外交关系。