面对争议不断的国务机要费案，台湾总统陈水扁星期四正式提出释宪，要求暂停审理此案。不过，在野泛蓝阵营批评，再多的司法技巧也无法包装贪污舞弊的事实。
台湾总统府副秘书长卓荣泰星期四代表陈水扁总统前往司法院声请大法官释宪。卓荣泰说，基于国家安全和外交机密的考量，总统可以主张国家机密特权，同时提出暂时处份声请，要求台北地方法院即刻停止国务机要费案的诉讼进行以及废弃合议庭开放阅卷的裁定。
*卓荣泰：已严重违反宪法*
卓荣泰强调，陈水扁总统亲自提出释宪，目的是在维护宪法的尊严，建立宪政体制。他说：“虽然形式上总统都不是当事人，但是在起诉书当中的载明都把总统当作形同是一个未经起诉的正犯，所以相关的侦察起诉程序，已经严重违反宪法第52条的规定和精神。”
台湾宪法第52条明文规定，总统除了犯内乱或外患罪，非经罢免或是解职，不受刑事上的诉究。
民进党主席游锡坤(方方土)也表示了力挺陈水扁总统的立场。他说，国务机要费案声请释宪是全党的共识，总统有专属职权和国家机密的特权，这部份要予以保障维护，主要是为了国家整体人民的利益，因此民进党支持对这部份提出释宪。
*国民党：并没有机密可言*
不过，在野的国民党表示，国务机要费预算经过立法院公开审查，并没有机密可言，就算有所谓的机密，在面对司法审理时，也必须负起查清真相的责任，民进党倾府院党全部之力，动用所有的资源，企图操控司法，只会引起台湾社会更激烈的反弹。
国民党认为，再多的司法技巧也无法包装贪污舞弊的事实，还呼吁陈水扁总统和民进党应该诚实面对司法的审判。
行政院长苏贞昌指示法务部研究国务机要费案声请释宪的可能性。苏贞昌星期四更进一步指出，声请释宪有一定的程序，行政院会遵照宪法程序来进行。法务部长施茂林也表示，目前正由法务部专案小组就现有法律规范进行评估，不过目前还没有具体的结论。
*亲民党：小偷告警察妨害人权*
在野的亲民党对此相当不以为然，并认为这是小偷偷东西被警察抓到，还要告警察妨害人权。亲民党立委张显耀要求苏贞昌院长到立法院进行报告：“下礼拜，如果要召开临时会，苏贞昌院长要率法务部长、检察总长一并到立法院报告并备询。”
此外，针对法务部奉命就国务机要费案研议是否提出释宪，侦办此案的查黑中心检察官陈瑞仁以及公诉庭的台北地检署主任检察官张熙怀都表示不赞同。张熙怀甚至以寒心表达他的心境。他说，这就像检察官在前线作战，法务部却去释宪扯后腿。