台湾执政的民进党在国务机要费侦查终结之后没有对陈水扁总统做任何处置。民进党立法委员李文忠与林浊水认为，民进党的处置不完全符合社会的期待，星期一以“诚信”为理由正式宣布辞去立委职务，但是不退党，这个星期内生效。
民进党前新潮流派系立法委员李文忠与林浊水星期一在立法院宣布辞职，几度强调“诚信”。林浊水说：“向过去支持民进党、疼爱李文忠与林浊水的朋友郑重宣布，我们辞去立法委员的职务。”他表示，民进党长期受到社会信任，是个追求民主、清廉、改革的政党，但是这样的信任受到社会质疑，为了信守过去的承诺，他们辞去立委职务。
*李文忠：党的处置未尽符合社会期待*
李文忠一度哽咽、红了眼眶，念出两人的辞职声明：“民进党一贯以高道德标准自许，并以此向社会诉求，也得到人民的信任与支持。在这样的标准下，过去对待同志涉案非常严格。就国务机要费案，我们以过去的标准，曾公开表示，总统涉案或起诉就应下台。如今，党的处置未尽符合社会期待。但从政者应有诚信，为表示负责，我们宣布辞去立法委员职务，本周内生效。”
国务机要费侦查结束之后，第一夫人吴淑珍以及3位总统幕僚被起诉，陈水扁总统则将在离任之后被追加起诉。民进党中执会把被起诉的4人移送中评会处置，但没有处份陈总统，引发党内不同声音。
*民进党席位减至84席*
李文忠辞职之后，民进党必须办理补选。林浊水是不分区立委，民进党可以派人递补，而依照之前的提名名单，将由渔业代表许德祥递补。民进党在立法院的席次将从目前的85席减少到84席。
李文忠与林浊水虽然辞去立法委员职位，但是没有退党。林浊水说，即使遭遇目前的挫折，他们还是相信，台湾如果还有改革的力量，只会在民进党，虽然辞去立委职务，但永远会为民进党继续努力。
对于两人的辞职声明，民进党主席游锡堃呼吁党员坚守岗位，团结合作。行政院长苏贞昌表示，世局也许乱，但是政府要团结，不能乱。民进党台北市长候选人谢长廷则表示，不管是选择留在岗位还是选择去职，都是负责任的表现。
*陈景峻：对党可能造成更大伤害*
民进党立法院干事长陈景峻表示，如果有意见，就应该在党内抒发，而在民进党危急存亡之秋，应该相忍为党。他说：“如果说在这个阶段意气用事地离开，对个人来说好像变成英雄，但是对党可能造成更大伤害。”
至于在野党方面，国民党发言人黄玉振肯定李文忠与林浊水的道德勇气，并呼吁民进党内更多具有反省能力的人能够在11月24号之前站出来，支持罢免案，让罢免案能够在立法院成案。国民党计划11月24号在立法院表决对陈水扁总统的罢免案。
在两人辞职的前一天，前总统府秘书长陈师孟建议陈总统明年年初以“因故无法视事”引退离职一年。此外，支持民进党的前国策顾问、义美公司总经理高志明经呼吁陈总统“自动请辞，含冤下台”。前中央研究院院长李远哲则透过公开信呼吁陈水扁总统考虑去留的问题。