在台湾总统陈水扁星期天对检方的国务机要费案侦结起诉书做出回应之后，有评论人士认为，虽然陈水扁面临的立即下台的危机已过，但是从长远来看，他的政治前途仍然困难重重。
*陈水扁的说明对蓝绿阵营起不同作用*
对陈水扁总统就起诉书所做的说明，民众的反应不尽相同。
泛蓝阵营响起一片鞭挞和批判声，认为陈水扁应该立即辞职下台。美国西东大学政治系教授、台湾问题专家杨力宇表示，台湾联合报、中国时报和TVBS电视所做的民调显示，大约七成的台湾民众不相信陈水扁的说辞，认为陈水扁是在用各种借口掩饰事实，继续欺骗人民，也就是说，陈水扁要说服一般民众的目的并没有达到。
不过，杨力宇教授指出，就像过去一样，陈水扁的报告对于台独基本教义派和深绿选民具有相当的稳定军心的作用，从而保证他们能在陈水扁剩余的任期内继续全力挺扁。泛绿阵营的台联党则一反此前支持罢免案的态度，表示要先“停、看、听”。
*分析：关键在四大天王一致支持*
西东大学政治系教授杨力宇认为，民进党内四大天王的一致支持，是陈水扁渡过危机的关键。
他说：“我认为，立即的危机是过了。因为陈水扁的说明至少稳住了民进党基本教义派，也稳住了民进党内部。因为民进党的四大天王非常支持他。副总统吕秀莲认为他的讲话很有说服力；民进党主席游锡方方土支持他；苏贞昌也表态支持他；谢长廷昨天说了天不会塌下来，今天又改口了表示支持他。所以说，陈水扁总统面临的立刻的危机过去了。”
*分析：陈水扁长远政治危机并未过去*
在台湾总统陈水扁拒不辞职下台的情况下，泛蓝阵营提出将在立法院第三次推动罢免陈水扁总统的议案。部份反省改革派的民进党立法委员提议陈水扁总统请假或暂时停止行使总统职权，静待调查。因此，杨力宇教授认为，从长远来看，陈水扁的政治生命仍然前途未卜。
他说：“但是从长远来看，我不认为陈水扁的政治危机已经过去。第一，现在正在推动第三次罢免案，虽然能过的可能性并不高，但是台联党至少有7到8席会投票支持，民进党可能也会有十几席松动。所以，第三次罢免案比第一、第二次更有可能；第二，施明德的红衫军行动如何。现在民众的愤怒到了非常高点，可能会出现更激烈的游行示威运动，甚至再来一次百万人包围总统府。”
杨力宇教授说，即使第三次罢免陈水扁的议案无法在立法院得到民进党立法委员的支持，泛蓝阵营还可以通过其在立法院占多数的优势推动冻结总统府和行政院的预算，导致总统府和行政院的运转瘫痪来迫使陈水扁下台。他说，陈水扁近期的危机虽然已经过去了，但是未来陈水扁仍然有很多困难需要克服。