台湾总统府高层出现重要的人事异动。在野党的国民党认为这次人事变动主要是选举考量，民进党方面也坦承这项人事安排有助于2008年的总统大选。
台湾总统府星期一晚间发布新闻稿说，国家安全会议秘书长邱义仁和总统府秘书长陈唐山的职位将相互调换，国家安全局长薛石民将调任总统府战略顾问，留下来的职缺由国安局副局长许惠佑升任。
国民党立法院党团书记长徐少萍认为，陈水扁安排邱义仁接掌总统府秘书长主要是希望借重惯于使用凶狠手段的邱义仁来赢得接下来的立委和总统大选。
*费鸿泰：未来选战激烈让人忧心*
国民党立委费鸿泰还指出，2004年总统大选时，在邱义仁的操盘下，上演了扭转选情的两颗子弹悬案。费鸿泰估计，未来选战之激烈将让人相当忧心。他说：“一个割喉割到断的秘书长上任，满城尽带肮脏事，你肮脏的手还会不会参与这次的立委和总统大选？”
民进党方面也不讳言的指出，这项人事安排是为了选举考量。民进党立院党团干事长王幸男表示，陈水扁总统已经就总统、立委选举展开布局。
*王淑慧：增加民进党打赢大选信心*
民进党立院党团副干事长王淑慧也表示，这项人事安排是对的，因为大大增加了民进党打赢2008年总统大选的信心。她说：“我们已经准备好我们的战斗团队，而且是派精英部队在部署。”
民进党主席游锡堃认为，陈水扁总统应该是考虑到时空和过去不一样而做这样的调整，如此可以让政府的运作更顺利，就党的立场来看，邱义仁接任总统府秘书长之后将兼任民进党中常委，对于党务推动和准备总统大选都将有很大的帮助。
邱义仁曾经担任民进党秘书长，在民进党执政之后，历任国安会副秘书长、行政院秘书长、国安会秘书长、总统府秘书长等职务，2004年5月担任国安会秘书长到现在，历次大选都成为民进党的辅选核心。立法院后来决议国安会、国安局不得参与政党辅选，邱义仁才退出了辅选的决策。
*第一位文人国安局长*
独派人士对陈唐山转任国安会秘书长也抱持了正面的看法，认为他将能发挥涉外事务的专长，推动台湾的外交工作。此外，针对国安局长薛石民转任没有实权的战略顾问，而由副局长许惠佑接任，许惠佑也成为第一位文人国安局长。
国民党方面批评，当初许惠佑在海基会秘书长任内就有谈判杀手的称号，接掌国安局长之后，对于未来的两岸关系一定有负面的影响。
