经过一天的党代会，台湾总统陈水扁于星期天正式出任民进党党主席。陈水扁表示，他相信由他兼任党政领导的新规定会促使“党政同步”。陈水扁在前半届的总统任内一直为党内派系斗争所困扰。
陈水扁任命前国民党政府成员、而不是主张独立的民进党忠实党员担任关键部会首长职务更是引起党内不满。陈水扁在任的头两年采取了政治中立的公开立场，因为当年他仅以39%的票数当选总统，民进党也没有取得立法院的多数。
* 新掌舵人 *
目前距离下届总统竞选还有不到两年的时间，陈水扁必须整合山头林立的民进党来治理台湾低迷的经济，处理与立法院的僵持局面，并就台湾地位问题与中国大陆政府改善关系。成为民进党的掌舵人后，陈水扁希望北京方面能更愿意与台北开展党对党的对话，从而回避那些迄今仍阻碍两岸政治谈判的一些问题。
从1949年中国内战结束以来，台湾一直与中国分治。但是北京始终坚持对台湾拥有主权，并且威胁说，一旦台湾宣布独立，、拒绝与大陆统一，北京将采取军事行动。
两岸直接通商和通航等过渡性步骤也停滞不前，关键障碍在于陈水扁政府拒绝接受中国政府提出的“一个中国”前提。北京在民进党删除党纲中的台独内容之前也不愿和民进党方面对话。
